Un articolo molto interessante sull'impatto che un allinamento sbagliato dei settori dei dischi può portare:

http://sqlblog.com/blogs/linchi_shea/archive/2007/02/01/performance-impact-of-disk-misalignment.aspx

Assicuratevi di leggerlo MOLTO bene prima di iniziare l'installazione del vostro SQL Server!